Genomic evidence of a single domestication origin for modern cattle
Auteurs : J. L. Miraszek, A. Cooper, B. Llamas, K. Chen, K. J. Mitchell, A. van Loenen, H. Heiniger, Y. Souilmi, G. Gower, H. J. Rowan, P. J. Wrinn, E. A. Diaz Miranda, S. E. Facioni Guimaraes, S. Vasil'ev, N. D. Ovodov, J. F. Taylor, R. D. Schnabel, J. E. Decker
Résumé scientifique
Domesticated cattle occur as humpless taurine and humped zebu, historically explained as two independent domestications in the Fertile Crescent and Indus Valley. We question the validity of this model using whole-genome analyses of cattle and their wild relatives, including extinct aurochs. Zebu derives from admixture between domesticated taurine cattle and Indian aurochs and has elevated genomic diversity from an ancient introgression of a gaur-like or banteng-like population into Indian aurochs. We identify selective introgression in zebu from both 238 Indian aurochs-derived genes enriched for environmental adaptation, and 283 taurine-derived genes enriched for domestication loci. We suggest this process was shaped by polygenic selection. Modern cattle diversity traces from a single domestication event, followed by migration, wild introgression, and selection.
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Buffalo Genome Projects: Current Situation and Future Perspective in Improving Breeding ProgramsAhmed M. Mousbah, Hesham M. Abdullah, Waleed S. Mohammed et al. · 2023 · Genomics · cité 1 fois · Résumé IA disponible
« Buffalo Genome Projects » examine le séquençage des génomes de buffles pour comprendre leur biologie et améliorer leur élevage, tandis que l’article étudie les origines génomiques des bovins domestiques.
Résumé scientifique
Buffaloes are farm animals that contribute to food security by providing high quality meat and milk. They can better tolerate the adverse effects of global climate change on their meat and milk production. Despite their advantages, buffaloes are heavily neglected animals with fewer studies compared to other farm animals, hence, the real potential of buffaloes has never been realized. The complete genome sequencing projects of buffaloes are essential to better understanding the buffalos biology and production since they allow scientists to identify important genes and understand how the gene networks interact to determine the critical features of buffaloes. The genome projects are also valuab…
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Genomic variation in a widespread Neotropical bird (Xenops minutus) reveals divergence, population expansion, and gene flowMichael G. Harvey, Robb T. Brumfield · 2014 · (2015) Molecular Phylogenetics and Evolution 83: 305-316 · cité 90 fois · Résumé IA disponible
« Genomic variation in a widespread Neotropical bird » utilise des données génomiques pour étudier la démographie historique, la divergence et les flux génétiques d’une espèce.
Résumé scientifique
Elucidating the demographic and phylogeographic histories of species provides insight into the processes responsible for generating biological diversity, and genomic datasets are now permitting the estimation of histories and demographic parameters with unprecedented accuracy. We used a genomic single nucleotide polymorphism (SNP) dataset generated using a RAD-Seq method to investigate the historical demography and phylogeography of a widespread lowland Neotropical bird (Xenops minutus). As expected, we found that prominent landscape features that act as dispersal barriers, such as Amazonian rivers and the Andes Mountains, are associated with the deepest phylogeographic breaks, and also that…
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Phylogenomics of captured Cryptosporidium sequenced directly from patient samples identifies clade-specific genomic architecture and host-adapted lineagesEliza V.C. Alves‐Ferreira, A. Khan, M. D. Tettey et al. · 2026 · Nature Communications · Résumé IA disponible
« Phylogenomics of captured Cryptosporidium » obtient et analyse des séquences génomiques pour caractériser des lignées et leur adaptation à l’hôte.
Résumé scientifique
Abstract Cryptosporidium causes diarrhea and high mortality in young children in Africa and southern Asia. Low oocyst counts in stool often limit whole-genome sequencing from clinical samples. Here, we enrich for Cryptosporidium genomic DNA directly from stool samples using 74,973 RNA baits (CryptoCap_75K; 8.2 Mb) derived from gene-rich areas (100% coding capacity) within the Cryptosporidium parvum genome. This method produces genome-wide sequence data with sufficient depth and breadth of coverage using as few as 25 oocysts, including divergent species such as Cryptosporidium ubiquitum . To minimize reference bias, we utilize a dual-mapping strategy that integrates reads aligned to both C. p…
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Reconstructing Roma history from genome-wide dataPriya Moorjani, Nick Patterson, Po-Ru Loh et al. · 2012 · Populations and Evolution · cité 67 fois · Pas encore résumé
« Reconstructing Roma history » analyse des données génomiques à grande échelle pour inférer l’ascendance et les migrations d’une population.
Résumé scientifique
The Roma people, living throughout Europe, are a diverse population linked by the Romani language and culture. Previous linguistic and genetic studies have suggested that the Roma migrated into Europe from South Asia about 1000-1500 years ago. Genetic inferences about Roma history have mostly focused on the Y chromosome and mitochondrial DNA. To explore what additional information can be learned from genome-wide data, we analyzed data from six Roma groups that we genotyped at hundreds of thousands of single nucleotide polymorphisms (SNPs). We estimate that the Roma harbor about 80% West Eurasian ancestry-deriving from a combination of European and South Asian sources- and that the date of ad…
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Observations and perspectives on the variation of biodiversityDirson Jian Li · 2018 · Populations and Evolution · preprint, non relu par les pairs · cité 1 fois · Pas encore résumé
« Observations and perspectives on the variation of biodiversity » traite de l’évolution et de la biodiversité à partir de séquences génomiques, sans étudier la domestication des bovins.
Résumé scientifique
Based on statistical analysis of the complete genome sequences, a remote relationship has been observed between the evolution of the genetic code and the three domain tree of life. The existence of such a remote relationship need to be explained. The unity of the living system throughout the history of life relies on the common features of life: the homochirality, the genetic code and the universal genome format. The universal genome format has been observed in the genomic codon distributions as a common feature of life at the sequence level. A main aim of this article is to reconstruct and to explain the Phanerozoic biodiversity curve. It has been observed that the exponential growth rate o…
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Bayesian Comparison of Covid Origins HypothesesMichael B. Weissman · 2026 · Populations and Evolution · Résumé IA disponible
« Bayesian Comparison of Covid Origins Hypotheses » compare des hypothèses d’origine à partir d’indices, mais porte sur l’émergence du Covid plutôt que sur celle des bovins domestiques.
En bref
L’article applique une comparaison bayésienne à plusieurs faits connus sur l’épidémie et conclut que les hypothèses liées à la recherche sont favorisées, même en tenant compte des incertitudes sur les probabilités a priori.
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Climate change, sea level rise, and the agricultural revolutionRidhika Mishra, Richard S. J. Tol · 2026 · General Economics · Résumé IA disponible
« Climate change, sea level rise, and the agricultural revolution » étudie l’invention et la diffusion de l’agriculture, tandis que l’article porte sur l’origine génétique des bovins.
En bref
L’étude confirme le rôle de la saisonnalité dans l’adoption agricole, mais conclut que la hausse du niveau marin et le changement climatique ont eu des effets limités face au progrès technique.
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Rhizobia transform legume nodules via native T-DNA transfer systemsS.-C. Hsieh, E.-M. Lai, C.-H. Kuo · 2026 · bioRxiv preprint · Résumé IA disponible
« Rhizobia transform legume nodules » étudie le transfert d’ADN et son expression chez des plantes, sans traiter de l’introgression génétique chez les bovins.
En bref
L’étude met en évidence des systèmes rhizobiens de transfert d’ADN qui transforment les nodules de leurs plantes hôtes et diffèrent des systèmes agrobactériens.
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Nous comparons le titre et le résumé de cet article avec ceux de tous les articles résumés sur ce site, et avec les articles que Semantic Scholar recommande, ceux qu’il cite et ceux qui le citent (pour un article très cité, ses citations les plus récentes et, depuis OpenAlex, les plus citées). Parmi les travaux antérieurs et les suites, les articles qui s’utilisent en profondeur, une méthode qu’il utilise et les suites très citées remontent un peu. Les niveaux (très proche, proche, apparenté) viennent de la similarité des textes, pas d’un jugement de qualité ; * signale un article sans résumé, comparé par son titre. La phrase sous un article est écrite par une IA à partir des deux résumés : vérifiez-la dans les articles. Un article jugé hors sujet par trois lecteurs quitte la liste.
Mis à jour le 9 novembre 2026.